熒光蛋白是如何發光的嗎？

熒光蛋白（FPs）于50多年前被發現，當時發現了綠色熒光蛋白（GFP），這是一種來自維多利亞水母的蛋白質。自從發現以來，熒光蛋白家族不斷擴大，有數百種變體可用。請繼續閱讀，以熟悉可用的FP發射顏色，并在為即將到來的實驗選擇熒光蛋白（或兩個）時記住10點。

熒光是吸收光的物質發射的光。發射的光的波長比激發波長長。因此，FPs是具有這種獨特能力的蛋白質。

當在大多數生物體中異位表達時，許多這些FP是熒光的。此外，將FP融合到另一種蛋白質通常不會影響其熒光。因此，FP用于研究許多生物學問題。兩個zui常見的用途是：1）測試特定系統中的表達水平（通過測量熒光強度）;2）可視化FP的定位（融合到感興趣的蛋白質），從而跟蹤活細胞內生物分子的定位。

熒光蛋白按發射顏色（發射波長范圍）分類

熒光蛋白通常按發射顏色分類，如下所述（或發射波長范圍）。通過突變GFP，衍生了藍色FP（BFP），青色FP（CFP）和黃色FP（YFP）的變體。有關GFP的細分，它是變體及其相關突變，請查看Marcy上周在GFP上的帖子。此外，在其他生物體中還發現了許多其他FP。

藍:424 - 467  nm

青色: 474 - 492  nm

綠: 499 - 519 nm

黃色: 524 - 538  nm

橙: 559 - 572 nm

紅: 574 - 610 nm

遠紅: 625 - 659 nm

紅外線: ≥ 670 nm

獨特的熒光蛋白類別

光活性/光轉換：當這些蛋白質被特定的激發波長激活時，它們可以改變它們的顏色。這意味著發射波長可以改變。在少數情況下，蛋白質的初始狀態是非熒光的，因此允許非常低的背景水平的熒光。這種光可解或光可轉換蛋白質的例子是PA-GFP，Dendra2和meEOS蛋白。一些蛋白質是可逆可切換的（例如rsEGFP，Dreiklang）。

熒光定時器（FT）：這些蛋白質會隨時間改變其顏色。因此，這些可以用作激活后細胞過程的“計時器”。四個主要的FT稱為慢FT，中FT，Fast-FT和mK-GO。

大斯托克斯位移（LSS）：斯托克斯位移（以George G. Stokes命名）是波長從激發到發射的轉變。對于大多數FP，斯托克斯位移小于50nm（通常要小得多）。對于LSS蛋白，斯托克斯位移≥100nm。具體來說，這些蛋白質被紫外線或藍光激發，它們的發射是綠光或紅光。例如，T-Sapphire、LSSmOrange 和 LSSmKate。

熒光傳感器：這些FP會根據環境變化（例如pH，Ca）改變其激發/發射行為2+助焊劑等）。zui常用的是GECI - 遺傳編碼的鈣指示劑（例如GCaMP）。其他包括：pHluorin & pHTomato（pH傳感器），HyPer（H2O2傳感器）、ArcLight（電壓傳感器）和 iGluSnFr（谷氨酸傳感器）。這些生物傳感器的更多例子可以在Addgene上找到。

分裂FP - 一些FP（例如GFP，Venus）可以分成兩半，它們本身是非熒光的。如果兩半非常接近，它們將形成完整的FP和熒光。分裂FP可用于確定融合到分裂FP一半的兩種蛋白質的接近程度。這種技術也被稱為雙分子熒光互補（BiFC）。

選擇熒光蛋白時要記住的8點

激勵和發射（ex/em）：

每個熒光蛋白都有其獨特的ex/em峰值。因此，請選擇系統可以激發的熒光蛋白，并檢測發射。例如，如果您的顯微鏡只有兩個激光器，分別為488nm和561nm，您將無法使用遠紅熒光蛋白。如果您沒有將藍光傳遞到探測器/相機的過濾器，那么BFP對您毫無用處。

當使用多個熒光蛋白時，請確保它們的發射光在波長上不重疊。在許多顯微鏡中，濾光片不夠窄，無法區分密切相關的顏色。此外，大多數FP具有廣泛的發射范圍，可以通過更長波長的濾光片檢測到（例如，GFP也發出黃光）。

請注意，FPs的某些組合會導致稱為FRET（熒光[或F?rster]共振能量轉移）的效應。當來自一個FP（例如CFP）的能量轉移激發另一個FP（例如YFP）的熒光時，就會發生FRET。FRET僅在兩個FP之間的距離<10nm時發生，并且在標記相互作用的蛋白質時應考慮。事實上，FRET通常用于確定兩種蛋白質是否相互作用。

齊聚：代FP容易寡聚。這可能會影響FP融合蛋白的生物學功能。因此，建議使用單體FP（通常用“m”表示為蛋白質名稱中的個字母，例如mCherry）。

氧：發色團在許多FP（特別是來自GFP的FP）上的成熟需要氧氣。因此，這些FP不能在缺氧環境中使用。zui近，從鰻魚中分離出的一種新的GFP被證明可以獨立于氧氣成熟，適合在厭氧條件下使用。

成熟時間：成熟時間是FP正確折疊并產生發色團所需的時間。這可以從翻譯后的幾分鐘到幾個小時。例如，超級文件夾GFP（sfGFP）和mNeonGFP可以在37°C下折疊<10分鐘，mCherry需要約15分鐘，TagRFP?100分鐘和DsRed?10小時。

溫度：FPs成熟時間和熒光強度會受到溫度的影響。例如，增強型GFP（EGFP）針對37°C進行了優化，因此zui適合哺乳動物或細菌研究，而GFP不銹鋼更適合酵母研究（24-30°C）。

亮度：亮度是衡量發射亮度的指標。亮度計算為蛋白質的消光系數和量子產率除以1000的乘積。在許多情況下，亮度與EGFP的亮度進行比較，EGFP設置為1。一些蛋白質非常暗淡（例如TagRFP657，其亮度為0.1），應考慮到這一點。光穩定性會受到實驗參數（例如激發光強度、pH 或溫度）的影響。

光：熒光分子在長時間暴露于激發光后被漂白（即失去發光的能力）。光穩定性可以短至100ms（EBFP）或長達1小時（mAmetrine1.2）。但是，對于大多數FP，它是幾秒鐘到幾分鐘。光穩定性可能受實驗參數（例如激發光強度、pH 值或溫度）的影響。

pH 穩定性：如果您計劃在酸性環境中表達FP（例如，微酸性酵母細胞質基質或突觸囊泡），則此參數很重要。一些FP具有不同的ex/em光譜（例如mKeima）或隨著pH值的變化而改變熒光強度（例如pHluorin，pHTomato）。

為什么選擇綠色熒光蛋白？

GFP是一種約27 kDa的蛋白質，由來自維多利亞水母的238個氨基酸組成。它在可見光譜的綠色部分具有熒光發射波長（因此得名），這是由于由蛋白質中心（Ser65，Tyr66和Gly67）的三個特定氨基酸的成熟反應形成的發色團。當被發現時，GFPzui令人驚訝的方面之一是發色團自發形成，沒有額外的輔助因子，底物或酶活性 - 它只需要在成熟過程中存在氧氣。這意味著蛋白質可以直接從維多利亞甲殼蟲中獲取，并在任何生物體中表達，同時仍然保持熒光。

蛋白質結構于1996年報道，是一種含有11 β片的“桶”形狀，發色團隱藏在結構的中心，不受水溶劑的淬火。這種緊密排列的結構解釋了整個GFP蛋白的重要性，這幾乎完全是維持熒光活性所必需的;截斷是可以容忍的，但是，點突變是可以接受的。與當時的傳統熒光染料相比，GFP的主要優勢在于它是無毒的，可以在活細胞中表達，從而能夠研究動態的生理過程。